在使用台式冻干机前必须要先进行预冻，预冻需要准备低温冰箱，零下40摄氏度，或者是零下80摄氏度的低温冰箱，把准备干燥的物品置于低温冰箱或液氮中，一般需要四个小时左右，可以直接从外面进行观察到，物品*冰冻结实后，才可进行冷冻干燥的实验，把物品迅速移动到冷冻干燥机托盘之内，以保证冷冻干燥效果。
 

　　台式冻干机控制软件系统为安卓系统，冻干过程均有可编程程序自动控制，可实时切换为人工操作，实现冻干过程全程参数控制，在运行过程中系统自动监控检测并记录储存相关数据，也可通过标配远程系统进行监控，储存多个固定或自定义程序，可数字密码签名
 

　　主机与真空泵之间由绿色的真空管连接，连接处使用标准卡箍。这种卡箍为了有效防止空气的泄漏，在卡箍内特别设计了一只密封橡胶圈，涂抹适量真空脂在橡胶圈上，再用卡箍卡紧，能使连接处更紧密的贴合在一起，从而有效的防止漏气。如果没有卡紧卡箍，就会造成空气泄漏，导致在抽取真空的时候仪表盘显示数显值大于20pa，此时就应该检查真空泵以及冷冻干燥机玻璃罩的气密性。
 

 

　　台式冻干机主机的右侧板上设有两个电源插座，一个将真空泵的电源线连接上主机，再将第二个设备上的总电源插上电源。
 

　　真空泵运转前必须检查是否加入真空泵油，否则不能正常运行。油面不得低于油镜的中线，真空泵刚开始使用时有比较强烈的抖动，慢慢的会变的平稳。
 

　　如果气密性不好，应该在冷阱上方的密封橡胶圈涂抹一些真空脂，将有机玻璃罩轻旋在橡胶圈上，在打开真空泵测试其封密性，以确保其封闭的完整。